Из-за недостаточно тщательно контроля за сохранностью со стороны властей Московский Кремль может быть исключен из списка наследия ЮНЕСКО. Ведущиеся на территории Кремля работы по реконструкции не были согласованы с комитетом, что является грубым нарушением их требований. Проекты по строительству корпуса в Тайнинском саду, двух павильонов около Кутафьей башни, а также реконструкции 14 корпуса закрыты для контроля общественности, что не могло не вызвать обеспокоенности со стороны общественных движений. ЮНЕСКО потребовал от Союза архитекторов России подробного отчета о состоянии памятника и планов по его содержанию, иначе вопрос об исключении Кремля будет снова поднят на заседании Комитета.

Еще один объект, который может быть исключен из списка наследия ЮНЕСКО – Куршская коса. На ее территории было решено создать туристическую зону, что не предусмотрено планом ее развития. Согласно Конвенции об охране памятников культуры и природы, российская сторона должна пригласить экспертов ЮНЕСКО для оценки проекта.

В апреле 2012 года был поднят вопрос о строительстве ГЭС на реке Кроноцкой, в Камчатском крае. Эта река протекает по территории Кроноцкого государственного заповедника и строительство ГЭС будет грубейшим нарушением обязательств России по охране культурного и природного наследия ЮНЕСКО. Кроме того, краевые власти собираются разрешить на территории парка геологические работы по изучению недр, что категорически было запрещено комитетом в 2004, 2007 и 2010 годах. Исключение вулканов Камчатки и Кроноцкого заповедника из списка наследия ЮНЕСКО позволит властям свободно добывать полезные ископаемые на территории Димшиканского и Анавгайсккого рудных узлов.

Невыполнение российской стороной экологических требований в отношении объекта культурного наследия «Озеро Байкал» может повлечь сначала включение его в список «Всемирное наследие под угрозой», а затем и вовсе исключение его из объектов охраны.