Здравствуйте!

Вопрос, если честно, не ко мне, но я знаю, что есть порталы, где за определённую плату делают профессиональный анализ фамилии (вроде того http://www.analizfamilii.ru/Yakub)

Но от себя скажу, что происхождение фамилии, к сожалению, ни о национальности, ни даже об этнической принадлежности ничего особо не расскажет, так как фамилия довольно распространённая. Вдобавок, аналоги с разными окончаниями есть в разных языках (например, Якубович, Якубов, Якубчик и т.д.). У моей фамилии, например, тюркское происхождение, но в роду -- только русские, украинцы, венгры и немцы; кого только нет, но ничего восточного :)) А так-то та же самая википедия пишет, что Якуб -- вообще имя арабского происхождения.

А вот здесь указано, что Якуб -- это польская форма еврейского имени Яков http://diclist.ru/slovar/russkih-familiy/e/jakub.html Вот это, мне кажется, ближе к вашей ситуации, так что ищите у себя польские, белорусские или западно-украинские корни. Но опять же, жить ваш дедушка по папиной линии мог где угодно.