Согласно экспериментам, гены, которые располагаются в одной хромосоме, при мейозе попадают в одну и ту же гамету. Таким образом, признаки, закодированные в этих генах, наследуются сцепленно. Данный феномен - феномен сцепленного наследования признаков - получил название закона Моргана.

Однако закон Моргана не является абсолютным, в природе часто встречаются отклонения от этого закона. У гибридов второго поколения небольшое число особей имеет перекомбинацию признаков, гены которых лежат в одной и той же хромосоме. Как это объясняет современная наука?

Дело в том, что в профазе первого мейотического деления происходит конъюгация (от лат. conjugatio - соединение) гомологичных хромосом. Эти соединившиеся между собой гомологичные хромосомы могут обмениваться своими участками. Данный процесс называется «кроссинговер» (от англ. crossing-over - перекрест).

Процесс кроссинговера крайне важен для повышения разнообразия среди потомков. Кроссинговер был также замечен Морганом и его учениками, поэтому его теорию наследственности, состоящую из трех основных пунктов, можно дополнить еще одним положением: в процессе формирования гамет гомологичные хромосомы конъюгируют, и в результате обмениваются аллельными генами, т.е. между ними происходит кроссинговер.

Итак, при кроссинговере нарушается выполнение закона Моргана. Гены одной хромосомы не наследуются сцепленно, т.к. некоторые из них заменяются аллельными генами гомологичной хромосомы. В данном случае, речь идет о неполном сцеплении генов.

Явление кроссинговера помогло ученым создать генетические карты хромосом, показывающие расположение каждого гена в хромосоме. Основываясь на генетических картах, можно составить предположительную схему хромосомного наследования.