Прошло 40 лет с тех пор, как Фукс был назначен ординарным профессором естественной истории и ботаники Казанского университета.
Интересные лекции молодого профессора сразу же покорили студентов. «В Казанском литературном сборнике» за 1878 год читаем: «...Он — первый особенно любимый и особенно увлекавший студентов профессор; первый — показавший студентам на живом примере собственной личности,— какой чарующей силой обладает ученый, до старости преданый своему делу...; какая живая связь возможна между таким ученым и учащейся молодежью».
После 14-летнего преподавания естественных наук Фукс был назначен профессором медицины. Особую признательность он получил как врач. С раннего утра его приемная наполнялась больными, иногда приезжавшими издалека. Он не делал различия между пациентами, будь то дворянин или мужик, всех встречая приветливо и обращаясь только на «вы». Татары и даже татарки предпочитали Фукса другим докторам. Он принимал энергичные меры для борьбы с возникшими эпидемиями, например, с распространившейся в 1830 году в Поволжье холерой. В 1820 году стараниями К. Ф. Фукса было напечатано на татарском языке руководство по практической медицине и гигиене.
К. Ф. Фукс с большим интересом относился к истории края, одним из первых написал очерк по истории Казани. Он увлекался собиранием монет, археологических древностей и других памятников старины. Часть его коллекции наряду с другими легла в основу нумизматического кабинета университета, который наряду с восточными рукописями был в пятидесятых годах передан Санкт-Петербургскому университету.
С большой симпатией относился Фукс к татарскому народу. Он интересовался его историей, жизнью и бытом, ежегодно присутствовал на Сабантуе. Широкую известность получила его книга «Казанские татары в статистическом и этнографическом отношениях», обстоятельное историко-этнографическое исследование, в котором ученый с искренней теплотой и глубоким знанием описал историю, быт, нравы и обычаи татарского народа, его нелегкую судьбу. Эта книга интересна и для современного читателя.
В доме Фукса нередко бывали деятели татарской культуры того времени, преподаватели университета А. Даминов, А. Мир-Мумминов, Н. М. Ибрагимов и члены его семьи, С. Кукляшев, М. Махмудов.
Татарское население Казани относилось к профессору К. Ф. Фуксу с большим почтением и искренней любовью.
