Уточните в бухгалтерии что они понимают под туманной формулировкой "не прошли больничные листы". Где они должны "пройти"? или у них есть сомнения в их подлинности? Вам по закону ОБЯЗАНЫ назначить пособие в течение 10 дней после предоставления документов и выплатить его в 100% размере в ближайший день з/п. Если бухгалтера скажут, что ждут когда им перечислят деньги ФСС, то это неправомерно. Компания должна выплатить вам из своих средств, а деньги им потом компенсируют.
Если это не будет сделано, пригрозите судом и обращением в трудовую инспекцию. Должно подействовать.