Ваша зарплата должна быть прописана как минимум в трудовом договоре, который вы подписывали при приеме на работу, вам должны были выдать 1 экземпляр на руки. Также, по-хорошему, вам должны выдавать расчетный лист, в котором прописаны все ваши начисления и удержания за месяц.

По поводу конкретных надбавок не могу ничего сказать, поскольку в медицине не работаю, к тому же в разных учреждениях они могут различаться. Знаю только, что за вредные условия труда положена не надбавка, а дополнительные дни отпуска.

По поводу проверок: нет такой инстанции, которая не сможет честно проверить деятельность вашей бухгалтерии. Если руководство не идет на встречу, значит пишите заявление в трудовую инспекцию, в управление здравоохранения по региону. Они обязаны разобраться.