В первую очередь, на всякий случай сделайте недоступными для кошки растения, которыми она может отравиться. Опасны диффенбахия, филодендрон, гортензия, фикус, молочай и многие другие.
После этого посмотрите внимательно на подоконники, есть ли там место для кошки. Может быть, она лезет к цветам просто, чтобы посмотреть в окно. Освободите небольшое место рядом с самыми пострадавшими цветами и возможно проблема уйдет. Если кошка ест цветы, попробуйте посадить для нее специальную траву. Если пытается использовать горшок как туалет, смените наполнитель, чтобы у кошечки была возможность рыться в своем лотке.
Если все это не помогло, можно приступить к стандартным методам дрессировки - увидели, что кот находится возле цветов, грозно сказали "Нельзя" и пригрозили пальцем. Не слушается - легкий шлепок по попе, можно газетой или брызгать из пульверизатора (одно из самый эффективных способов воспитания).
Попробуйте отпугивать запахами - можно разложить корки от цитрусовых в горшках (не все кошки не любят этот запах) или намазать горшки эфирным маслом с резким запахом или бальзамом звездочка. Сами цветы и землю можно обработать настоем полыни или перца, цветам или кошке это не нанесет вреда. В зоомагазинах продаются специальные спреи, но не все эти средства эффективны и безопасны.
Дополнительно можно разложить фольгу, наклеить скотч, воткнуть зубочистки в землю. Какой именно способ подействует на вашего любимца угадать невозможно.
Если ничего не помогло, можно использовать укрывной материал и закрыть землю или поставить мини-заборчик на подоконник.